一、发酵床养殖的准备
1、发酵床在进行发酵时必须的条件是湿度（25-40%）和温度（15-35度）。
2、生益益生源发酵床菌种处于干燥环境中进入休眠状态，没有活性不死亡。遇到水分温度激活。
3、垫料原料选用，一般使用锯末和稻壳各半混合做垫料。它对垫料原料种类的要求不严，可以是锯末、稻壳、刨花、花生壳、玉米芯、玉米秸秆等等，可因地制宜采集原料，能降低成本。
4、发酵床铺设操作，将垫料原料中均匀添加菌种，可在棚舍发酵池中直接制作，也可在舍外集中统一制作。
5、发酵床垫料厚度：猪60--80公分。鸡40厘米，鸭40厘米。牛舍垫料层高度夏天为60cm左右，冬季为80-100cm.
6、发酵床要看饲养动物不同，水分多少，垫料厚薄度，翻动垫料。
7、发酵床使用寿命，是根据饲养动物不同，垫料厚薄度。原料等多种因素造成，一般使用2—5年。
二、发酵床养殖的具体操作方法
发酵床垫料主要分三层：
层，首先在层铺一些玉米秸秆等，按每平方加入1公斤益生菌菌液均匀搅拌，水分掌握在30%左右（手握成团、一触既散为宜）。
第二层，中间一层要铺上稻草，然后在喷洒一遍益生菌液。
第三层，铺上用益生菌喷洒后的粉碎的玉米秸秆，、充分混合搅拌均匀，边喷洒，边翻堆，直至拌均匀，在搅拌过程中，使垫料水份保持湿度（25-40%）（现场实践是用手抓垫料来判断，即物料用手捏紧后松开，感觉蓬松且无水分渗出较为适宜），将拌好的物料堆积成垛进行发酵。发酵床垫料发酵成功的标准：发酵好的垫料手感松软，略带酸香或清香味，有时会见到白色菌丝，温度在30~40度左右。
，发酵好的垫料摊开铺平，覆盖上面整平，厚度约10cm左右，然后等待24小时方可使用。如畜禽在圈中跑动时，表层垫料太干，灰尘出现。说明垫料干燥，水分不够，应根据情况喷洒些水分，因为整个发酵床中的垫料中存在大量的微生物菌群，通过微生物菌群的分解发酵，发酵床面一年四季始终保持在25度左右的温度，为畜禽的健康生长提供了一个优良环境。