在养猪过程中引起免疫抑制的因素主要有疾病、理化、药物、营养、应激等等，特别是一些免疫抑制性病原会造成疫苗免疫失败与诱发各种疾病。
1.病原因素
在临床上，许多病原微生物既可导致动物机体器官组织发生病变，又可诱导机体产生明显的免疫抑制，造成双重危害。如猪瘟病毒可导致胸腺萎缩，B淋巴细胞减少。猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRS）可损伤免疫系统和呼吸系统，肺泡巨噬细胞是该病毒主要的繁殖场所，容易被破坏，从而导致免疫抑制等。
2.理化因素
霉菌毒素能毒害巨噬细胞使其不能吞噬病原微生物，从而引起严重的免疫抑制；许多重金属可抑制免疫应答而导致免疫失败；某些化学物质（如过量的氟、卤素等）可引起免疫系统组织部分甚至全部萎缩以及活性细胞的破坏，进而造成免疫抑制。
3.药理因素
许多抗生素对B淋巴细胞的增殖有一定抑制作用，进而影响免疫应答反应。如长期滥用地塞米松等糖皮质激素类药物、氯霉素类、四环素类药物等，可损害免疫功能。
4.营养因素
如饲料中营养成分配比不合理，某些维生素和微量元素或缺乏或过多等等，都对免疫力有显著影响。特别是缺乏维生素A、D等多种微量元素及全价蛋白时，能影响机体对抗原的免疫应答，使免疫反应受到抑制。
5.应激因素
免疫功能在一定程度上受到神经、体液和内分泌的调节，如在过冷、过热等应激状态下，机体肾上腺皮质激素分泌会增加，能显著损伤T淋巴细胞，对巨噬细胞也有抑制作用，从而使免疫功能受损。
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